Fakultas Kedokteran Universitas Pattimura bertujuan mengembangkan potensi peserta didik agar menjadi manusia yang beriman dan bertakwa kepada Tuhan Yang Maha Esa,berakhlak mulia, sehat, berilmu, cakap, kreatif, mandiri, dan menjadi warga negara yang demokratis serta bertanggung jawab. Prodi Pendidikan Dokter Unpatti sebagai lembaga pendidikan tinggi, berperan mengembangkan sumberdaya manusia dan meningkatkan harkat dan martabat manusia umtul mewujudkan bangsa yang maju, mandiri dan sejahtera.